黑神话悟空的故事暗藏玄机。开篇一战及大圣之死，并非因大圣思念花果山或天庭看不惯灵山，而是悟空发现了足以颠覆神魔认知的秘密，这个秘密让他面临灭口之危。打金怪掉落的玲珑内丹介绍提及，天地强者以肉身为炉，精气神为药可炼成仙丹。蜘蛛精这一关，巨灵棺出现后，贺仙人称自己莽撞闯祸，缴了天上的买卖，还烧上个自不量力的小女娃，要将她炼成金丹。
问题一：贺仙人是谁？从白眼魔君隐身图对话可知，白羊让子猪儿吞下大圣六根之一续命是贺仙人的阴谋，要用紫猪儿和猪八戒的感情线让八戒黑化，阻止天命人。原著中七个蜘蛛精本是七仙女，被贬后被八戒杀了六个，剩下紫珠儿对八戒念念不忘。贺仙人在与白眼魔君对话中提到，陛下和娘娘全看在眼里，不曾理会是给几分面子。由此可推出仙界陛下是玉皇大帝，娘娘是王母娘娘。
问题二：天上的买卖是什么？巫山夫人送贺礼，其中有玉帝给王母的照骨镜，王母送给了蜘蛛精。情郎仙隐身图显示，有人从昆仑阆苑投下两枚仙卵，一枚度化有罪者成火焰魔君，一枚炼成情郎仙。昆仑阆苑住的人是王母。白眼魔君打斗画面中有操控之人，且喊师祖救我。几乎可断定这一关幕后是天庭势力。
问题三：为什么单单要把四妹练成金丹？四妹因指引天命人被封在盘丝洞，后因被印符所封动弹不得。贺仙人结语“试成了，你走，他们留下”，可见天庭把妖界当菜地，养熟炼丹维持长生不老假象。原因有四：其一，原著中唐僧师徒取经遇 41 个妖怪，半数被天庭或灵山收走。悟空成佛后却说长生不老长不了，因他发现神佛用妖怪炼成仙丹续命，不愿同流合污。其二，小怪摩天鹰隐身图显示，炼丹造孽害命夺人内丹者被天庭召回做天将。其三，开头战斗并非因大圣不服管教，而是悟空发现秘密，天庭怕秘密泄露诛杀他。其四，八戒女神图暗示不听话的神仙靠边站，反抗天庭线有迹可循。如西游记原著奉宣郡三年不下雨，因玉帝发怒颁布禁令。游客将此句放在第二结局，暗示神仙不一定好，妖魔不一定坏。由此可推出天命人打妖怪不仅为收集肉根，还可能是反抗天庭。弥勒和二郎神的对话及女神图可证明弥勒有计划，要先摆脱金箍束缚，大圣之死一战各方有后台，第六根二郎神后台是麋鹿。好结局是粉碎阴谋，若有后续 DLC 可能是大闹天宫，未放出或许因时间赶或怕得罪人。